Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax7P47239 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax7P47239 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax7P47239 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax7P47239 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms