Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sdc2P43407 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdc2P43407 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms