Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf5P43027 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf5P43027 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf5P43027 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms