Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf9P41274 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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Tnfsf9P41274 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfsf9P41274 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf9P41274 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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