Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col18a1P39061 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col18a1P39061 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms