Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpargP37238 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PpargP37238 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PpargP37238 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpargP37238 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpargP37238 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpargP37238 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PpargP37238 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpargP37238 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpargP37238 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpargP37238 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpargP37238 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms