Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin1P35438 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin1P35438 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin1P35438 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin1P35438 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms