Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab20P35295 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms