Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd1P33215 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms