Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh15P33146 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms