Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KrasP32883 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KrasP32883 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KrasP32883 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KrasP32883 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KrasP32883 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KrasP32883 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KrasP32883 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KrasP32883 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms