Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc5P32043 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc5P32043 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms