Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OatP29758 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OatP29758 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OatP29758 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OatP29758 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OatP29758 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OatP29758 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OatP29758 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OatP29758 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OatP29758 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OatP29758 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OatP29758 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OatP29758 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OatP29758 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OatP29758 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OatP29758 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OatP29758 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OatP29758 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OatP29758 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OatP29758 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OatP29758 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OatP29758 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OatP29758 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OatP29758 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OatP29758 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OatP29758 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OatP29758 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OatP29758 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OatP29758 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OatP29758 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OatP29758 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OatP29758 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OatP29758 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OatP29758 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OatP29758 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OatP29758 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms