Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms