Protein–RNA interactions for Protein: P29387

Gnb4, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb4P29387 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb4P29387 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb4P29387 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb4P29387 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms