Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprmP28828 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprmP28828 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtprmP28828 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprmP28828 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprmP28828 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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