Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kif5cP28738 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Kif5cP28738 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif5cP28738 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif5cP28738 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif5cP28738 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif5cP28738 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif5cP28738 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms