Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col2a1P28481 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms