Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LoxP28301 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LoxP28301 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LoxP28301 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LoxP28301 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LoxP28301 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LoxP28301 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LoxP28301 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LoxP28301 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LoxP28301 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LoxP28301 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LoxP28301 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LoxP28301 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms