Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aco1P28271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms