Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lef1P27782 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lef1P27782 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lef1P27782 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms