Protein–RNA interactions for Protein: P27546

Map4, Microtubule-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map4P27546 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map4P27546 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map4P27546 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map4P27546 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map4P27546 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map4P27546 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map4P27546 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map4P27546 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map4P27546 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Map4P27546 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map4P27546 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map4P27546 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map4P27546 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map4P27546 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map4P27546 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map4P27546 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map4P27546 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map4P27546 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map4P27546 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Map4P27546 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map4P27546 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map4P27546 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map4P27546 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map4P27546 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map4P27546 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Map4P27546 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Map4P27546 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Map4P27546 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map4P27546 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Map4P27546 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map4P27546 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map4P27546 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map4P27546 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map4P27546 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Map4P27546 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Map4P27546 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Map4P27546 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map4P27546 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Map4P27546 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map4P27546 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map4P27546 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map4P27546 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Map4P27546 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map4P27546 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map4P27546 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map4P27546 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Map4P27546 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Map4P27546 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Map4P27546 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Map4P27546 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Map4P27546 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Map4P27546 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Map4P27546 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms