Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CftrP26361 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CftrP26361 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CftrP26361 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CftrP26361 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CftrP26361 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CftrP26361 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CftrP26361 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CftrP26361 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CftrP26361 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CftrP26361 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CftrP26361 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CftrP26361 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CftrP26361 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CftrP26361 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CftrP26361 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CftrP26361 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CftrP26361 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CftrP26361 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms