Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col8a2P25318 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col8a2P25318 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms