Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd11P23813 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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