Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata3P23772 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms