Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZfaP23607 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms