Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsta3P23591 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsta3P23591 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsta3P23591 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms