Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja1P23242 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms