Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PparaP23204 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PparaP23204 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PparaP23204 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PparaP23204 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PparaP23204 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PparaP23204 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PparaP23204 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PparaP23204 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PparaP23204 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PparaP23204 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PparaP23204 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PparaP23204 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PparaP23204 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PparaP23204 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PparaP23204 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PparaP23204 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms