Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp36P22893 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp36P22893 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms