Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RarbP22605 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RarbP22605 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RarbP22605 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RarbP22605 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RarbP22605 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RarbP22605 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RarbP22605 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RarbP22605 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RarbP22605 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RarbP22605 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RarbP22605 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RarbP22605 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RarbP22605 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RarbP22605 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RarbP22605 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RarbP22605 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RarbP22605 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RarbP22605 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RarbP22605 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RarbP22605 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RarbP22605 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RarbP22605 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RarbP22605 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms