Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prim1P20664 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prim1P20664 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prim1P20664 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prim1P20664 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms