Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fcer1aP20489 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms