Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcaP20444 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms