Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl9P18340 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxcl9P18340 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms