Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptbp1P17225 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms