Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp53P15975 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp53P15975 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp53P15975 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms