Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrphP15331 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrphP15331 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrphP15331 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrphP15331 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrphP15331 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrphP15331 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrphP15331 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrphP15331 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrphP15331 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrphP15331 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms