Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q9P14431 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Q9P14431 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms