Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn1P12960 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn1P12960 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn1P12960 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms