Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr4a1P12813 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr4a1P12813 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr4a1P12813 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms