Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb1P12658 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb1P12658 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb1P12658 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb1P12658 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calb1P12658 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms