Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga5P11688 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.9 ms