Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp1P11103 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp1P11103 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp1P11103 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp1P11103 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp1P11103 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms