Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc6P10629 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc6P10629 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms