Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd4P10628 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd4P10628 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms