Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P10404 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P10404 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P10404 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P10404 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P10404 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P10404 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P10404 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P10404 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P10404 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms