Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CatspereP0DP43 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CatspereP0DP43 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms