Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Amd1P0DMN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Amd1P0DMN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amd1P0DMN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms